Les fermes biologiques bourguignons sont au nombre de 464 à la fin de l’année 2007. Cela représente une surface totale de plus de 29.000 ha, soit 2% de la surface agricole bourguignonne.
Les nombres de fermes et les surfaces cultivées en bio sont en augmentation, quoique lente depuis 2 ans. En effet, leurs évolutions sont assez liées au système d'aide français et européen. Or, on assiste aujourd'hui à un ralentissement car l'aide à la conversion est plafonnée par exploitation; cela a tendance à pénaliser la conversion de grandes fermes.
Les principales productions sont les céréales (très présentes dans l’Yonne) et l’élevage (dans la Nièvre, notamment). Les autres productions telles que les légumes, la vigne, les plantes médicinales et la production de fruits ont cependant plutôt tendance à accroître leur place dans l’agriculture biologique de notre région.