Sur les 583 799 ha certifiés en 2008, 2/3 étaient des surfaces toujours en herbe ou des surfaces cultivées avec des plantes fourragères. Les grandes cultures couvraient 20% des surfaces en mode de production biologique et les cultures pérennes (vigne et arbres fruitiers) entre 6 et 7%. L’année 2008 a été marquée par une forte augmentation des surfaces en vignes, qui confirme les tendances observées en 2007. Les PPAM (Plantes à Parfum Aromatiques et Médicinales), les légumes frais et les fruits ont aussi des dynamiques de forte progression.

Il y a 177 fermes pratiquant de l’élevage en Bourgogne ; la grand majorité en système bovins viande (60%), ou ovins et bovins viande (6%).
L’année 2007 a été marquée par un certain nombre d'arrêts (17) de certification, que ne compensent malheureusement pas les nouveaux arrivants (9). La conjoncture n’est effectivement pas très favorable, et ce, surtout pour les fermes d'élevage qui ne produisent pas leurs aliments : en effet, la forte hausse des prix des céréales a fortement impacté le prix des aliments, dans un contexte où la « prime bio » (c’est à dire le différentiel de prix entre la viande non bio et bio) n’est pas toujours en adéquation avec les coûts de  production.
La filière s’organise, cependant, avec la confortation de la structure coopérative Eleveurs Bio de Bourgogne qui a pris le relai de l’activité de BioBourgogne Viande.
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Pour toute l'info sur les filières et les producteurs biologiques de Bourgogne, allez à la documenthèque pour télécharger l'Observatoire Régional de l'Agriculture Biologique - édition 2007. 

Il y a 155 fermes qui cultivent des céréales, protéagineux et oléagineux en Bourgogne ; le département de l’Yonne en regroupe une large part, avec plus de 5 300 ha sur un total d’environ 13 000 ha. La surface moyenne d’une exploitation est de 107 ha, et 40% d’entre elles sont spécialisées en grandes cultures, ce qui signifie qu’il n’y a pas d’élevage associé.
La tendance de cette filière est au maintien des surfaces, mais on note depuis le changement de modalités d’aide en 2006, un ralentissement des conversions.
Pour connaître des fermes qui vendent des produits issus des grandes cultures (farine, huiles, lentilles..) aller sur la rubrique Annuaire
Pour plus de détails, consultez l'ORAB .

Fin 2007, 100 domaines viticoles sont notifiés en agriculture biologique en Bourgogne, essentiellement en AOC. Cela représente 960 ha (3% de la SAU bourguignonne, mais 5,6% en Côte d’Or). On constate une très forte augmentation des demandes de conversions depuis 2 ans, ce qui permet à la Bourgogne de regagner son retard sur les autres grandes régions viticoles françaises.
10 viticulteurs biologiques adhèrent à la charte de vinification biologique (téléchargez la), proposée par la FNIVAB .
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Pour plus de détails sur la viticulture biologique en Bourgogne, téléchargez l'ORAB

Le nombre de fermes cultivant des légumes biologiques en Bourgogne est en augmentation depuis 4 ans ; les surfaces cultivées progressent également pour atteindre 126 hectares fin 2007 (62 fermes). Elles sont inégalement réparties entre les départements avec une forte prépondérance de la Côte d’Or, puis de l’Yonne.