 7 398 entreprises de transformation et de distribution certifiées en 2008
Depuis 1995, l'observatoire national de l'agriculture biologique recense les entreprises de préparation et de distribution certifiées en agriculture biologique. La forte augmentation constatée depuis 2006 résulte essentiellement de l'évolution de la réglementation : depuis le 1er juillet 2005, l'obligation de certification a été étendue aux distributeurs de produits biologiques.
Evolution du nombre de préparateurs et distributeurs certifiés en agriculture biologique
 Plus de 5 600 préparateurs de produits biologiques certifiés en 2008
Le nombre d’entreprises réalisant des opérations de transformation de produits agricoles biologiques, de conservation et/ou de conditionnement, rassemblées dans la catégorie des « préparateurs1 », s’élevait à 5 626 dont près de 9% étaient spécialisés bio en 2008 (+12% par rapport à 2007).
Profil des entreprises de préparation en 2008
Les entreprises de transformation, de conservation et de conditionnement de produits biologiques sont diversifiées, mais le secteur végétal prédomine largement :
- 87% des préparateurs ont une activité principale dans le domaine des productions végétales
- 12% dans les productions animales
- 1% était multi produit ou des restaurateurs ou traiteurs
Par activité bio principale en 2008, nous avions :
- 60% fabriquaient des produits de boulangerie - pâtisseries
- 4,5% étaient impliquées dans le secteur des fruits et légumes
- 3,2% dans la production de vin
- 3,1% dans la fabrication d’huiles essentielles
- 7% dans le secteur des viandes
- 3,2% dans le secteur des produits laitiers
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BioBourgogne Association (BBA) rassemble différents types d'acteurs de la bio en Bourgogne soucieux de développer la bio bourguignonne. 
Les producteurs bio de Bourgogne sont organisés en 4 groupements départementaux (GAB), fédérés régionalement en une Confédération des Groupements des Agrobiologistes de Bourgogne. 
Le SEDARB (Service d’Eco-Développement Agrobiologique et Rural de Bourgogne), est chargé d’apporter des conseils techniques aux producteurs et d’animer le développement de la bio.